下一代生物信息学工具无需编程专业知识即可实现大数据分析

时间 : 2023-07-31 10:12:44 来源 : 互联网


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导读 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心的研究人员开发了一种新的数据分析工具,它采用了用户友好的自然语言界面,允许没有生物信息学或编程语言...

德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心的研究人员开发了一种新的数据分析工具,它采用了用户友好的自然语言界面,允许没有生物信息学或编程语言专业知识的生物医学研究人员对大型数据集进行直观分析。

这项开放获取、人工智能(AI) 驱动的计划名为 DrBioRight,旨在降低所有研究人员充分利用现代研究方法中生成的日益大量数据的障碍。该平台的报告今天发表在《Cancer Cell》杂志上。

“我们认为,我们可以通过创建任何研究人员都可以使用的工具来改进当前进行常规生物信息学分析的模型,并大大加快周转时间,”生物信息学和计算生物学教授韩亮博士说。“我们 DrBioRight 的长期目标是成为每位研究人员的智能合作者。”

现代生物医学研究中使用的高通量技术会生成大型、复杂的数据集,提供有关正在研究的患者、动物模型或细胞系的全面信息。例如,这些可能包括研究整个遗传信息(基因组学)、基因表达(转录组学)或蛋白质表达(蛋白质组学)。

梁解释说,由于这些“组学”数据集非常复杂,因此在没有专门的分析方法的情况下回答特定的生物学问题可能具有挑战性。这些分析通常是使用用各种编程语言编写的计算机脚本来完成的,这需要对编程和生物信息学有一定的了解。

生物信息学家可以帮助导航和处理这些复杂的数据集,但这项工作可能非常耗时。因此,研究团队开发了DrBioRight,使研究人员能够通过用户友好的聊天界面和自然语言交互,更轻松地对自己的数据进行常规分析。

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